Научным руководителем ФГБУН ФИЦ МГИ является член-корреспондент РАН, член-корреспондент НАНУ, доктор физико-математических наук, профессор Геннадий Константинович Коротаев.

Ученая степень: доктор физико-математических наук (1981 г.).
Ученое звание: старший научный сотрудник (1982 г.), профессор (1992 г.), член-корреспондент НАНУ (2009 г.), член-корреспондент РАН (2016 г.).
Должность: научный руководитель Федерального государственного бюджетного учреждения науки Федерального исследовательского центра «Морской гидрофизический институт РАН».
Образование: Механико-математический факультет Московского государственного университета им. М.В.Ломоносова.
Государственные награды: Государственная премия Украины в области науки и техники (2005 г.), Премия Правительства Российской Федерации в области науки и техники (2007 г.)
Награды за отдельные научно-организационные достижения: награжден Почетной грамотой и памятным знаком за заслуги перед городом-героем Севастополем.
В 1971 г. Г.К. Коротаев защитил диссертацию кандидата физико-математических наук, а в 1981 г. – диссертацию доктора физико-математических наук по специальности «Геофизика» в МГИ АН УССР. В 1982 г. Президиумом АН СССР ему присвоенное ученое звание старший научный сотрудник по специальности «Геофизика», в 1992 г. – звание профессора по специальности «Геофизика», в 2009 г. – члена-корреспондента НАН Украины, в 2016 г. – члена-корреспондента РАН.
Г.К. Коротаев в рамках НАН Украины являлся руководителем ряда программ, таких как «Спутниковая океанология», «Зондирование», «Методика». В 1987–1997 гг. руководил направлением «Дистанционное зондирование Океана» в рамках Рабочей Группы АН СССР – НАСА (США) «Науки о Земле», был ответственным исполнителем проектов НАСА «СИВИФС» и «Симбиоз», совместного проекта НАСА, ДЛР (Германия), РАН (Россия) и НАН Украины «МОЗ-ПРИРОДА», проекта НАСДА (Япония) «АДЕОС». В 1997–2005 гг. являлся ответственным исполнителем проектов Европейского Космического Агентства ЕКА и Космического Агентства Франции КНЕС, направленных на комплексное использование данных европейского Космического Агентства «ЭНВИСАТ» для исследований и мониторинга динамики и экосистемы Черного моря. Совместно со специалистами Вашингтонского Университета (США) и Института Морских Наук (Турция) и при финансовой поддержке Европейского Филиала Офиса Морских Исследований (США) является со-руководителем программы использования в Черном море буев-профилемеров, позволяющей на основе новейшей технологии проводить регулярные оперативные наблюдения профилей температуры и солености морской воды.
Г.К. Коротаев является Национальным Координатором и членом Управляющего Комитета программы «Вlасk Sеа GООS», созданной под эгидой Межправительственной Океанографической Комиссии ЮНЕСКО для координации усилий стран региона по созданию наблюдательной системы Черного моря. В 1999 –2007 гг. – член Управляющего Комитета и ответственный исполнитель проектов НАТО «Наука ради Мира», в последнее время – член Управляющего Комитета и научный руководитель проектов Пятой, Шестой и Седьмой Рамочных Программ Европейской Комиссии «АРЕНА», «АСКАБОС», «ЕКУП», «СИМБИОЗ», «Мой Океан».
С 2015 года является руководителем темы госзадания ФГБУН ФИЦ МГИ «Оперативная океанография». В 2015 – 2019 гг. являлся руководителем ряда проектов РФФИ и проекта в рамках программы Президиума РАН. С 2017 года является руководителем проекта РНФ направленного на создание макета системы оперативных морских прогнозов Мирового океана, Арктического и Азово – Черноморского бассейнов, исследования по которому успешно завершаются в текущем году. Кроме того, в настоящее время он является руководителем проекта РФФИ по программе «Опасные явления».
В 2015 – 2020 годах Г.К. Коротаев активно выступал с презентацией своих исследований на многих отечественных и международных конференциях. Развитие методов и средств оперативной океанографии были представлены им в докладах на форумах Армия 2015, 2016, 2020 и мероприятиях, организованных ГШ ВМФ РФ. Г.К. Коротаев активно участвует в работе секции Океанологии, физики атмосферы и географии ОНЗ РАН, регулярно выступая с научными докладами.
За 2015 – 2020 годы Г.К. Коротаевым подготовлено более 30 публикаций из них 25 в изданиях, индексируемых в базах WoS и Scopus.
Г.К. Коротаев – председатель Ученого Совета ФГБУН ФИЦ МГИ, член редколлегий «Морского гидрофизического журнала» и журнала «Исследования Земли из космоса» РАН.
Г.К. Коротаев активно занимается подготовкой научных кадров, пользуется заслуженным авторитетом и уважением сотрудников института и в международном научном сообществе. В возглавляемом им научном коллективе защищено более 16 кандидатских и 5 докторских диссертаций. Ведет работу по популяризации достижений науки выступая на телевидении. В последние 4 года он являлся организатором четырех школ для молодых ученых Российской Федерации, посвященных современному состоянию оперативной океанографии.